Kopējais apstiprinātais budžets 2009.gadam ir Ls 33 565 173. 2008.gadā LU budžets bija Ls 47 581 592 (pēc 2008.gada 1.decembra grozījumiem). Samazinājums salīdzinājumā ar 2008.gadu ir 29%. Pamatbudžets samazināts par 16%, taču visvairāk samazinājums skāris zinātnisko darbību un citus projektus –2008.gadā tam bija atvēlēti gandrīz 13 miljoni latu, bet 2009.gadā par 66% mazāk, tikai aptuveni 4,5 miljoni.
Finansējuma samazināšanos zinātnei galvenokārt ietekmējuši divi faktori, skaidro LU. Pirmkārt, ir noslēgusies virkne projektu, kuri tika aizsākti iepriekšējos gados, bet jauno, īpaši ERAF un ESF, piesaiste plānota tikai šā gada otrajā pusē. Otrkārt, tas tiešā veidā saistīts ar to, ka 2009.gadā šim nolūkam LU valsts finansējums nav piešķirts vai piešķirts mazākā apjomā. Nav piešķirti līdzekļi LU zinātniskās darbības attīstības un infrastruktūras nodrošināšanai, kā rezultātā iesākto projektu turpināšanai līdzekļi būs jārod no tā jau samazinātā LU kopējā budžeta Ls 200 000 apmērā. Vairāk nekā par pusi – par 55% mazāki šajā budžetā ir plānotie izdevumi LU zinātniskajiem institūtiem – 2009.gadā tie būs mazāk nekā 1 miljons latu, 2008.gadā tie bija vairāk nekā divas reizes lielāki - 2,2 miljoni latu.
Samazinājums skāris arī LU aģentūru – zinātnisko institūtu un uzņēmējdarbības budžetu – 2008.gada beigās apstiprinātais budžets bija Ls 14,7 miljonu apmērā, 2009.gadā – Ls 8,9 miljoni, attiecīgi samazinājums – 39%.
2009.gada budžeta plānotie kopējie izdevumi LU administrācijai un infrastruktūrai, kurā ietilpst universitātes koplietošanas līdzekļi, veido Ls 11,9 miljonus, 2008.gadā tie bija Ls 18,2 miljni, un samazinājums kopā ir 34% apmērā. LU fakultātēm 2009.gadā apstiprināti budžeta izdevumi Ls 17,6 miljoni, samazinājums, ieskaitot līdzekļus zinātniskiem projektiem, salīdzinot ar iepriekšējo gadu ir 26%.
LU ieņēmumos valsts dotācija no vispārējiem ieņēmumiem studiju programmu realizācijai 2009.gadā veido Ls 12 946 672, tas nozīmē samazinājumu par 27% salīdzinājumā ar 2008.gadu.